LabDAO-ի հիմնական թիմի անդամ Լիլի Հանսեն-Գիլիսը
SynBioBeta.
Folding@home նախագիծը վերնագրեր է դարձել COVID-19 համաճարակի ողջ ընթացքում՝ չօգտագործված հաշվողական հզորությունը օգտագործելու համար՝ ուսումնասիրելու սպիտակուցների ծալովի որոնման տարածքը՝ նոր կորոնավիրուսի դեմ պայքարելու համար: Քաղաքացիներին հնարավորություն տալով լինել ինքնուրույն գիտնական՝ նախաձեռնությունն իրականացրեց սպիտակուցների տարբեր մոլեկուլային կոնֆիգուրացիաների լայնածավալ սիմուլյացիաներ ամբողջ աշխարհում «գրանցված» համակարգիչների բաշխված ցանցում:
Այս ապակենտրոնացված պարադիգմը ազդարարվեց մարդկանց ընդհանուր խնդրի շուրջ համախմբելու և ամբոխի աղբյուրներից հաշվողական հզորությունը արդյունավետորեն համախմբելու համար, բայց ի՞նչ, եթե հաշվողական հզորությունը և խնդիրների լուծման ենթակառուցվածքը հակադարձվեն: Այլ կերպ ասած, ինչ կլիներ, եթե անհատները կարողանան իրականացնել իրենց սեփական նախագծերը՝ օգտվելով կուտակված հաշվողական հզորությունից և գործիքները կենսաբանական փորձարկումների համար.
LabDAO-ն իրականություն է դարձնում այդ երազանքն իր PLEX հարթակով: PLEX-ը բաց կոդով հրամանի տող գործիք է, որը նախատեսված է ոչ միայն հաշվողական ռեսուրսների, այլև կենսաբանական մեքենայական ուսուցման մի շարք գործիքների (ստեղծվել է «BioML» փաթեթը LabDAO-ի շրջանակներում) հասանելի դարձնելու համար տարբեր ծագումներով: Անկախ նրանից՝ փորձեր կատարելով փոքր մոլեկուլների ամրացման, թե սպիտակուցների ծալման սեփական սիմուլյացիաների հետ, PLEX-ը թույլ է տալիս օգտվողներին մուտք գործել LabDAO-ի գործիքների գրադարան, կիսվել արդյունքներով և պատկերացնել դրանք հինգ րոպեից պակաս ժամանակում:
Գործիքների այս հավաքածուն և դրա վերևում դրա օգտագործման հնարավորություն ընձեռող հարթակը ցուցադրվել է Zuzalu's Blockchain Meets Biology գագաթնաժողովում ապրիլի սկզբին, որտեղ LabDAO-ի հիմնական թիմի անդամ Լիլի Հանսեն-Գիլիսը սկզբից մինչև վերջ ցուցադրեց ներքին մոլեկուլային դինամիկայի մոդելավորումը: սպիտակուցը գտնելու իր ամենակայուն կոնֆիգուրացիան: Այնուհետև, որպես ինքնահռչակ «ոչ կոդավորող», նա լսարանին քայլեց սկզբից մինչև վերջ՝ բոլորը համակարգչով, WiFi-ով, PLEX-ով հրամանի տողում և ոչ ավելին:
Ավելի լայնորեն, LabDAO-ն ապակենտրոնացված հարթակ է վեբ3-ի միջոցով (ավելի մեծ «DeSci» շարժման մի մասը), որը նպատակաուղղված է բաց կոդով թմրամիջոցների հայտնաբերման համար ավելի արդյունավետ միջավայր ստեղծելուն: Գործիքներն ու ռեսուրսները առաջադեմ հասանելի դարձնելով ավելի լայն էկոհամակարգի համար՝ LabDAO-ն նպատակ ունի ստեղծել ճիշտ միջավայր թափանցիկ և մատչելի գիտական առաջընթացի համար: Անկախ նրանից՝ վերացնելով հետազոտողների՝ սեփական ապարատային կամ հաշվողական ենթակառուցվածք ունենալու անհրաժեշտությունը, կամ հրապարակելով փորձերի արդյունքները բլոկչեյն մատյանում այնպես, որ դրանք հաշմանդամ և վերարտադրելի լինեն, կազմակերպությունը պարտավորվում է համագործակցության միջոցով հնարավոր դարձնել ավելի շատ նորամուծություններ. օգտագործելիություն և սիլոեդ, խորշի փորձաքննություն:
LabDAO-ի ջանքերը՝ կառուցելու ապագայի այս DeSci աշխարհը այսօրվա համար, վերջերս ավելացել են 3.6 միլիոն դոլարի ֆինանսավորման փուլի տեսքով տարբեր այլ DAO-ներից, Inflection.xyz-ից, Balaji Srinivasan-ից և այլն: Աջակցության այս հոսքը կնպաստի բաց կոդով ծրագրային գործիքների ստեղծման և LabDAO-ի հետազոտական էկոհամակարգի ամրապնդման շարունակական ջանքերին:
Ինչ վերաբերում է հենց PLEX-ին, հորիզոնում անմիջական հաջորդ քայլերը ներառում են պլատֆորմի փորձարկում տարբեր գիտական համագործակցություններում, տարատեսակ գործիքների կոնտեյներավորում և BioML ցանցը խթանելու համար անհրաժեշտ սարքավորումների կուտակում:
Ինչ վերաբերում է երկարաժամկետ հեռանկարին, ապա, հավանաբար, հաջորդ կյանքը փրկող դեղամիջոցը հաջորդ խոշոր վարակիչ հիվանդության բռնկման ժամանակ նախագծված կլինի PLEX-ի հզորությամբ՝ մեկ ապակենտրոնացված քայլ առաջ: Քանի որ էկոհամակարգը շարունակում է աճել, ցույց կտա ժամանակը:
Շնորհակալություն Աիշանի Աատրեշ այս հոդվածի վերաբերյալ լրացուցիչ հետազոտությունների և հաշվետվությունների համար: Ես SynBioBeta-ի հիմնադիրն եմ, և որոշ ընկերություններ, որոնց մասին գրում եմ, հովանավորներ են SynBioBeta կոնֆերանս. Լրացուցիչ բովանդակության համար կարող եք բաժանորդագրվել իմ շաբաթական տեղեկագիրը.
Աղբյուր՝ https://www.forbes.com/sites/johncumbers/2023/06/02/labdao-is-charting-the-future-of-open-source-ai-for-drug-discovery/